Стабилизатор напряжения

[ceramic]

Как повлияет использование в качестве D1 диода шотки BAT54?

Ни как. Впрочем, как и вообще использование диода. Вместо Диод+R3 поставте резистор 1кОм -- результаты стабилизации мало изменятся.

Вот незадача , и на последней версии схемы тот же баг , при падении напряжения на аккумах до 7,5V , напряжение на атоме поднимается с 3,16V до 3,42V - это не есть "зер гуд" . Высмотрел в инете вот такой вариант , может как то к нашей схеме его привернуть

А зачем? Если соглашаться с дросселем,то лучше от стандартной схемы отталкиваться.