Дырочку в силиконовой пробочке лучше делать в виде воронки, т.е. расширенной частью воронки в сторону атома,а сужаться дырочка должна в сторону жижи в карте. Если в вашем замечательном швейцарском ноже есть шило, то это как раз самый удобный девайс для изготовления дырочек-воронок.
И всё же лучше высечь пробочку, так будет меньше брака. Можно и вырезать, но тогда хотя бы по отпечатку карта. Просто сильно вдавить карт в силикон, можно даже чем-то тяжёлым сверху стукнуть, оотпечаток профиля гарантирован, по нему и резать острым лезвием.