не слишком ли сложноваты шильд получится?)) Так то конечно можно, для начала можно основу собрать, без аром... Но боюсь в шильде всё это будет слишком мелко...
нормально. в шильдике генезиса нормально же видно белок... имхо, тоже в jmol-е делали.
связи атомов можно сделать тоньше, цвета поменять
короче, займусь вечером, как ребенка сдам :-)